Az L-ciszteint elsősorban az orvostudományban, kozmetikában, biokémiai kutatásokban használják; kenyéranyagokban használják a glutén képződésének elősegítésére és az erjedés, a penész elősegítésére és az öregedés megakadályozására. Természetes gyümölcslevekben használják, hogy megakadályozzák a C-vitamin oxidációját és megakadályozzák a gyümölcslé megbarnulását. A termék méregtelenítő hatású, akrilnitril-mérgezésre, aromás acidózisra alkalmazható.